1885~1888年间，杜波依斯依靠邻居们的捐助，在田纳西州纳什维尔的一个传统的黑人大学——菲斯克大学（英语：Fisk University）就读。 在南方的旅行和居住成为杜波依斯第一次体验南方的种族歧视，其中包括吉姆·克劳法、偏见和私刑处死黑人。